可见，当前两岸经济体潜在的互补性优势的进一步发挥、竞争性问题的协调、两岸经贸往来与相互依存性中不对称特征的消减、两岸经济交流合作的进一步扩展以及两岸经贸往来对两岸经济发展贡献的进一步提高，都有赖于两岸公权力在经济体制机制与法规政策层面的制度性协调与合作。这显然构成当前建立健全两岸经济合作机制的一个内在需要。
在外部环境层面，世界经济的全球化趋势及其各种组织表现形式，特别是在全球多边层面建立的世界贸易组织(WTO)与在区域多边及双边层面蓬勃发展的区域经济一体化组织，在为两岸经济体提供更多发展机会的同时，显然也构成两岸经济发展和两岸经济关系发展共同面临的外部威胁因素。同为WTO成员的两岸经济体都面临着如何在WTO有关规则约束下进一步增强交流合作、如何在经济全球化与区域一体化深化发展中进一步谋求各自最大化利益，增强国际竞争力，防止边缘化，并有效应对国际市场的不确定性与风险的问题。一个可以选择的方式就是建立健全两岸经济合作机制，推进两岸经济的制度性合作与一体化发展。
此外，在两岸当前的政治经济关系状态与内外环境条件下，建立健全两岸经济合作机制，推进两岸经济一体化发展，全面深化两岸经济合作，不仅是两岸应对内外经济环境、实现经济关系和谐发展、追求利益最大化的必然要求，而且也有助于发挥两岸经济关系对两岸政治关系的促进作用，对于密切两岸联系、稳定两岸关系、促进两岸和平发展有着重大的现实意义。
正是鉴于建立经济合作机制，推进两岸经济一体化，具有如上所述的重要意义和作用，2005年四五月连、宋大陆行时两岸正式提出了“两岸共同市场”及“两岸自由贸易区”的制度性一体化议题。并且，随着主张两岸交流合作并承认“九二共识”的中国国民党再次在台湾执政，建立两岸经济合作机制，推进两岸经济一体化，也就具有了必要的政治基础。因此，自2009年6月开始，两岸启动了两岸经济合作框架协议(ECFA)的协商谈判，并于2010年6月底签署了这一协议。两岸经济由此初步踏上了制度性交流合作与一体化发展的道路。当前，两岸当局应当而且可以在ECFA的基础上进一步推进两岸经济合作机制建设，从而推进两岸经济制度性合作与一体化发展，全面深化两岸经济合作。而要确保两岸经济合作的长期稳定与持续发展，笔者认为必须做到以下几点：
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