苏军和俄军的军事指挥体制改革大致可分为3个阶段。第一阶段是探索成立战略方向司令部阶段。
在海空军逐渐主导战场、军队机动能力不断增强的背景下，苏军的战场协同、指挥体制逐渐不能与之相适应。1977年举行的“西方-77”大规模联合军事演习，暴露出了苏军不同军兵种作战单元间存在着严重的战场协同问题。
为改革庞大、繁杂、低效的作战指挥体系，苏军组建了战略方向司令部，作为战略方向上的战役-战略军事集群指挥机关。战略方向司令部拥有对所在战区内除战略火箭军、战略空军、军事运输空军等中央直属部队外各军兵种部队的作战指挥权。
1979年，后贝加尔湖军区、远东军区、太平洋舰队、2个空军集团军和1个防空兵部队整合进远东战略方向司令部，作为苏联在远东所有军事集群的统一战略指挥机关。随后，西部战略方向司令部、西南战略方向司令部、南部战略方向司令部相继组建。
战略方向司令部的组建，可使各军兵种和军事集群在战役-战略层次上的战场协同更为紧密，指挥员能够在更广阔的战场空间和总体上把握战区局势，做出正确指挥决策。
苏军组建战略方向司令部时曾担心总参谋部、军兵种司令部和军区之间实行协同指挥会使军事指挥体系更为复杂，实际运行状况正是这样。另外，军区的作战指挥权移交给战略方向司令部，遭到了军区所属相关人员的强烈抵触。直至苏联解体，战略方向司令部的职责关系一直没有理清，同时也未被授予过指挥全权。最终，苏军总参谋部中止了战略方向司令部的运行。
第二阶段是成立地区司令部和职能司令部阶段。俄军的第一次车臣战争失利，第二次车臣战争惨胜，与美军在海湾战争、科索沃战争的轻松取胜形成了鲜明对比，促使俄军启动了新一轮军事指挥体制改革。
