《法治周末》质疑《科学地解决道德难题》的主要内容与美国《科学》杂志上Greene等人的论文部分内容一致。方舟子介绍,他2001年就对这一指控进行反驳。记者查到他2006年5月的一篇博文说:“这个指控被《科学》编辑部所否定(理由就是第一,我说明了是他人的工作,第二,我是用自己的语言做的复述)”。
方舟子对羊城晚报记者说,他写的这三篇都是科普文章,科普文章本来就是普及科学知识,展示科学界的成果,但哪怕按美国的做法,都是不用很严格地注明出处的。所以,按照论文的标准去要求科普文章是荒谬的,两者适用两个不同标准。
方舟子3月30日还发表博文说,《法治周末》称其母校美国密歇根州立大学 的罗伯特·鲁特伯恩斯坦“确认了方舟子《科学是什么》一文抄袭了他已经发表的文章”,这是造谣,因为该教授已转来信件,明确指出他从来没有认定过方抄袭其文章。