“防御性公投”与“入联公投”，在大陆的眼中，都是变相的“台独公投”，是一丘之貉。
第二，“防御性公投”是恶化台湾与美国关系、导致与美国关系重新处于紧张的行为。美国早就表明了反对“防御性公投”的态度，对“防御性公投”的“台独”性质有明确的界定。这不会因为国民党的同意而改变。
早在2003年12月31日，美国国务院副发言人艾瑞里就已首度把台湾的“防御性公投”视为片面影响台海现状的举动，再次强调了美国反对台湾单方面采取行动改变两岸关系现状的立场，并且加重语气呼吁台湾要小心。2003年12月陈水扁签署了“公民投票法”，这项法案赋予了台“防御性公投”的权利。美国总统布什在12月接待到访的中国总理温家宝时对陈水扁提出了严厉的批评。
据知，美国在台协会台北办事处长杨苏棣1月29日拜会国民党主席吴伯雄，表达美方关切“入、返联公投”立场，希望“公投”不要变成“蓝绿喊价”，触动美中敏感神经。可见，在“公投”方面，美国对民进党、国民党都不放心。
第三，“防御性公投”的推出并不能解决蓝绿阵营的你死我活的斗争格局，必将继续激化台湾民众的矛盾，甚至完全有可能成为陈水扁与民进党对付国民党的十面埋伏妙计。国民党如果中计，就没有赢的希望。
中评社记者林淑玲分析指出，至于扁抛出愿意朝野协商“公投”案，摆明也是假议题；在绿营坚持“公投绑大选”，蓝营反对的情况下，双方根本没有交集，遑论还要坐下来谈。扁这个动作很清楚的是一石二鸟，他可以向美国交代，表示他很有诚意愿与在野党协商，为箭在弦上的“入联公投”寻求解决方案，但在野党拒绝。对于国民党，这项所谓的第三案，就是要用来与极可能登场的“台湾加入联合国”的“立法院”决议相抗衡，避免被蓝营的决议案所套住，进退两难。
2004年3月，陈水扁得以连任，除了“319枪击案”的影响，他用“防御性公投”来绑选票也是重要因素，他第一次用两项“谘询性公投”来绑住了选票。食髓知味。说穿了，“防御性公投”不过是陈水扁手中的又一把捍卫民进党政权的杀手锏罢了。
国民党对陈水扁的回应是：“防御性公投”不适合提，国民党方面不是笨蛋。
社评说，我们充分理解国民党的心情，最大的目标是为了赢取政权。但是，如果在自己长期坚持的路线方面略有偏移，就会带来无限的被动。如果随陈水扁起舞，那更是不知哪一步就会掉进深渊。当初，陈水扁提出“入联公投”，国民党争之以“返联公投”，结果导致自己跌入泥潭挣扎至今。前车之鉴，不能不使国民党警醒过来。
对于陈水扁设下的重重圈套，只有警醒过来，绝不误入，甚至反其道而行之，国民党才不是笨蛋。
